菌株簡(jiǎn)介 |
DUALmembrane系統(tǒng)是DUALsystems BioTech公司開(kāi)發(fā)的專門篩選跨膜蛋白間相互作用的檢測(cè)技術(shù),它利用分離的泛素系統(tǒng)(split-ubiquitin)直接檢測(cè)天然狀態(tài)下膜蛋白間的相互作用,是目前市面上唯一檢測(cè)膜蛋白間相互作用的酵母雙雜系統(tǒng)。此系統(tǒng)采用NMY51酵母菌株,可直接轉(zhuǎn)化質(zhì)粒進(jìn)行蛋白互作驗(yàn)證或篩庫(kù)試驗(yàn);此菌株Transformation marker為: trp1, leu2-3,報(bào)告基因?yàn)椋篐IS3, ADE2 和 lacZ,第一步通過(guò)營(yíng)養(yǎng)缺陷型報(bào)告基因(HIS3, ADE2)進(jìn)行選擇性生長(zhǎng)篩選,進(jìn)一步通過(guò) LacZ 報(bào)告基因進(jìn)行β-半乳糖分析顯色的定量或半定量篩選,三個(gè)獨(dú)立的報(bào)告基因,受不同啟動(dòng)子的調(diào)控,降低假陽(yáng)性幾率。原理:泛素(ubiquitin)分子量很小,由 76aa 殘基組成;泛素作為降解信號(hào)分子,可以連接另外一種蛋白質(zhì)的 N 端,然后被泛素專一性蛋白酶(UBPs)識(shí)別,從而導(dǎo)致與泛素相連的蛋白被酶解。泛素可以人為分成兩部分:N 端(Nub),C 端(Cub)。首先,人為地將泛素 Nub 的 3 位異亮氨酸突變?yōu)楦拾彼幔∟ubI 突變?yōu)?NubG)。這樣與 Cub 的親合力大大降低,避免了 Cub 和 Nub 自我結(jié)合或接近的可能性。其次,將Cub 部分與人工合成的 LexA-VP16 轉(zhuǎn)錄激活因子融合成一個(gè)融合蛋白Cub-LexA-VP16。正常條件下 NubG不與Cub 結(jié)合,UBPs 也不能識(shí)別分離的泛素,轉(zhuǎn)錄激活因子也不會(huì)被切下來(lái)。最后,將要檢測(cè)的蛋白質(zhì)分別與NubG和Cub融合,形成 bait 融合蛋(bait-cub-LexA -VP16)和 prey 融合蛋白(prey-NubG)。如果 bait 和 prey發(fā)生相互作用,就會(huì)促使 NubG 和 Cub 的相互接近,被 UBPs 識(shí)別,導(dǎo)致 LexA-VP16 的解離,進(jìn)入核內(nèi),從而激活報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄。 此系統(tǒng)可使用四種Bait質(zhì)粒:pBT3-N,pBT3-SUC,pBT3-STE,pBT3-C,篩選標(biāo)志均為L(zhǎng)EU;三種Prey質(zhì)粒:pPR3-C ,pPR3-SUC,pPR3-STE,篩選標(biāo)志均為TRP。NMY51酵母菌株可用YPDA在28℃有氧的條件下培養(yǎng),然后使用30%的甘油保藏菌種。 |